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基因组光学图谱构建系统

规格型号:Bionano Saphyr
仪器分类:分析仪器 -> 生化分离分析仪器 -> DNA测序仪
生产厂商: 美国BioNano Genomics公司
仪器类别: 通用
仪器状态: 正常
河南省农业科学院芝麻研究中心
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1. 基本配制
1)主机一套;
2)控制台式计算机一台;
3)数据分析服务器一台;
4)仪器配套操作软件一套,包含图像数据处理转化,数据分析,以及拼接组装模块;
a)基于DNA单分子图谱的图像数据绘制全基因组高精度酶切图谱;
b)基于DNA单分子图谱的图像数据检测基因组中kb级别结构变异,包括插入、缺失、移位、倒位,重复序列等;
c)可在28小时内完成基因组大小为3 Gb的物种全基因组组装。
2. 技术参数
1)成像系统:
a)激发光源:固态激光器;
b)激光器数量:≥2,1个用于DNA检测,至少1个用于标记检测;
c)聚焦模式:硬件聚焦;
2)检测芯片:
a)每个芯片含2-3个Flowcell,每个Flowcell含百万个纳米泳道;
b)主机搭载两个芯片位,通量:5000Gb X 2 /芯片,或(5000Gb×3/芯片(已验证样本);
c)DNA加样量:300—900ng;
d)DNA标记精度:±150bp;
e)DNA标记分辨率:500 bp。
基于DNA大分子内切酶位点分布及荧光标记技术,通过实现超长单分子高分辨率荧光成像,完成动植物基因组DNA序列排列和图谱构建。主要应用范围包括:1)绘制全基因组高精度酶切图谱;2)检测基因组中kb级别结构变异,包括插入、缺失、移位、倒位,重复序列等;3)与高通量测序数据混合拼接,构建完整基因组测序数据。
绘制全基因组高精度光学图谱;检测基因组中的结构变异;辅助全基因组拼接。
需要使用本仪器的单位或个人可通过网上预约或直接与我单位联系。我单位将根据用户需求,及时提供服务。
预约申请方式:提前2周电话或现场预约;
预约申请及服务时间:周一至周六。
协议收费。
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